原因一：直接感染真菌
引起灰指甲的主要原因来自真菌的传染，是由皮肤癣菌、酵母菌及非皮肤癣菌的霉菌(简称霉菌)感染甲板或甲下所致的疾病，真菌侵入甲板周围皮肤或甲下组 织，然后分泌角质蛋白酶分解角质，破坏甲组织而引起感染。所以灰指甲在本质上具备传染特性。真菌生活能力极强，在自然界中几乎无处不存在，从大气中、动植物体上、人类粪便、地板上和土壤里都能发现真菌，因此感染的可能性非常大。
原因二：间接感染真菌
常见的交叉传染多发现于群居生活，比如学生宿舍、员工宿舍、家庭生活等，毛巾、抹布等卫生用品共同使用，导致灰指甲的交叉传染。
值得注意的是，灰指甲具备传染性，但不具备遗传性。部分患者家中亲友感染灰指甲比较多，误解为灰指甲具备遗传性。其实不然，这主要是生活在一起的群体，在日常中交叉感染，导致家族多人感染。少数家族感染灰指甲，这是因为家族基因，导致身体机能差，抵抗力差，容易感染灰指甲，而不是灰指甲的遗传。
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